جلسات اسکایپ

سلام دوستان در این بخش ویدئوی جلسات اسکایپی که نکات مهمی داخل آن ها مطرح شده برای شما قرار داده میشود. حتما مشاهده بفرمایید. دانلود ویدئو این جلسه دانلود ویدئو این جلسه

جلسه چهارم آنالیز Single Cell

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه به آخرین نکات تکمیلی در آنالیز Single Cell میپردازیم. مهمترین نکته‌ای که در این ویدئو خدمتتون آموزشش را داریم این است که چگونه جدول Countهای…

جلسه سوم آنالیز Single Cell

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه که به واقع ادامه‌ای هست بر جلسه اول scRNA-Seq، با هم آنالیز در پکیج Seurat را پیشرفته‌تر یاد میگیریم. یاد میگیریم که اینکه هر سلول…

جلسه دوم آنالیز Single Cell

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه باهم یادمیگیریم که چطور فایل‌های FASTQ حاصل از توالی یابی scRNA-seq را آنالیز کنیم و به جدول Count برسونیم. با توجه به تنوع پروتکل‍های scRNA-Seq به…

جلسه اول آنالیز Single Cell

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه به مهمترین بخش آنالیز Single Cell میپردازیم. پر از نکته و طولانی، حتما استراحت رو در میان مشاهده این ویدئو مدنظر قرار بدید.    اگر سوال علمی…

دوره جامع آنالیز داده‌های بیان – جلسه شانزدهم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه به مهمترین بخش آنالیز Single Cell میپردازیم. پر از نکته و طولانی، حتما استراحت رو در میان مشاهده این ویدئو مدنظر قرار بدید.  دوستان عزیز با عرض…

جلسه ششم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه به موضوعات مهم ذیل میپردازیم: 1- Multi-Condition DE Analysis 2- Gene Ontology Enrichment Analysis 3- Co-Expression Network Construction and Module Detection دانلود اسلاید نهایی دوره…

جلسه پنجم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه به دو موضوع مهم میپردازیم: 1- Batch Effect Correction در داده‌های RNA-seq با بهترین و جدیدترین متد 2- رسم انواع Plotهای مورد نیاز در مسیر…

جلسه چهارم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه با بهره‌گیری از دو مسیر به فراخوانی ترانسکریپت‌ها (ایزوفرم‌ها) و همچنین ژن‌های DE پرداخته‌ایم. این جلسه حاوی یک آزمون برای شماست.

جلسه سوم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در این جلسه با سه روش متفاوت به استخراج DEGها از Gene level count table پرداخته شده است. دوستان عزیز توجه بفرمایید که با یک ویدئو طولانی و…

جلسه دوم

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوستان عزیز در جلسه دوم فایل‌های SRA نمونه‌های افراد سالم و بیمار را به فایل‌های FASTQ تبدیل میکنیم و مسیر آنالیز را تا ساخت Count Table که در آن شمارش،…

جلسه اول

دانلود پیوست درس دانلود کل محتوای درس بصورت یکجا سلام دوست عزیز این جلسه شروع بررسی داده‌های بیان حاصل از توالی یابی NGS یا به اصطلاح Bulk RNA-Seq هست.   فایل حاوی لینک‌های دانلود دیتای SRA دوره سوالات علمی و…