اگر قصد یادگیری Expression analysis رو با یه دوره همه‌چی تموم داری، اینجا همونجاست. در این دوره تمام مباحث مربوط به RNA-seq، scRNA-seq، circularRNA analysis on RNA-seq data آموزش داده شده که در زیر با جزئیات تمام سرفصل‌ها را برای شما آوردیم.
این دوره توسط آقای میلاد عیدی تدریس میگردد.
این دوره شامل سرفصل‌های زیر هست:
مطرح‌شده در بخش Bulk RNA-Seq
- مقدمات طراحی یک آزمایش RNA-Seq
- Gene level differential expression analysis using HISAT2-FeatureCounts-DESeq2-EdgeR-Limma
- Isoform level (Transcript level) differential expression analysis using HISAT2-StringTie-Ballgown & Kallisto-Sleuth
- Batch Effect Correction
- Plotting
- Multi-Condition differential expression analysis
- Gene ontology enrichment analysis
- Co-expression network construction & functional module detection using WGCNA
- Module Membership & Gene Significance Analysis
- Network Visualization in Cytoscape
- فرآیند فرآخوانی واریانت‌ها از دیتای RNA-Seq
در بخش Single Cell RNA-Seq
- Introduction to Single Cell RNA-Seq protocols
- FASTQ files to cellular count matrix (از فایل خام توالی‌یابی تا ساخت جدول Countها براساس هر سلول)
- Cell clustering using Seurat
- Cluster-based count matrix extraction
سرفصل‌های بخش CircRNAs:
- Introduction
- Identification and quantification of circRNAs using two pipelines
- Differential Expression Analysis of circRNAs
محتوای دوره
Microarray Analysis
Bulk RNA-Seq Analysis
Single Cell RNA-Seq Analysis
Circulating RNA Identification and quantification
فرم‌های دوره