NGS و بیوانفورماتیک

دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS

آشنایی با تحلیل تغییرات تعداد نسخه در NGS؛ از آماده‌سازی داده و ExomeDepth تا مرور چارچوب تفسیر CNV.

Milad Eidi ۶ درس
دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS
رایگان

ضمانت بازگشت وجه ۳۰ روزه

چه چیزی یاد می‌گیرید

  • شناخت مفهوم CNV و روش‌های بررسی آن
  • آشنایی با آماده‌سازی داده Paired-End و اجرای CNV Calling با ExomeDepth
  • دنبال‌کردن مراحل مرور نتایج و مباحث ACMG/ClinGen مطرح‌شده در دوره

درباره‌ی این دوره

این دوره مسیر بررسی CNV یا تغییرات تعداد نسخه را در داده‌های NGS معرفی می‌کند. آموزش از مفاهیم و روش‌های بررسی CNV آغاز می‌شود و سپس مراحل آماده‌سازی داده، فراخوانی و تفسیر را دنبال می‌کند.

مباحث اصلی در چهار بخش آموزشی ارائه شده‌اند. در فهرست محتوای موجود، فایل داده‌های دوره و یک جلسه تکمیلی نیز قرار دارند تا بتوانید منابع مرتبط را از همان بخش درس‌ها پیدا کنید.

مسیر چهارمرحله‌ای دوره

  • مفاهیم و محیط کارآشنایی با CNV، روش‌های بررسی آن و نصب لینوکس مجازی.
  • آماده‌سازی دادهشبیه‌سازی توالی‌یابی، Alignment داده Paired-End و اجرای مراحل به‌صورت Loop.
  • فراخوانی CNVساخت ایندکس و دیکشنری ژنوم FASTA و آشنایی با ExomeDepth.
  • مرور و تفسیر خروجیبررسی نتایج و مرور چارچوب ACMG/ClinGen معرفی‌شده در آموزش.

این دوره برای چه کسانی مناسب است؟

  • دانشجویان و پژوهشگران علاقه‌مند به تحلیل CNV در داده‌های توالی‌یابی.
  • کارشناسانی که با مسیر عمومی NGS آشنا هستند و می‌خواهند بررسی تغییرات تعداد نسخه را دنبال کنند.

پیشنهادهایی برای شروع بهتر

  • آشنایی مقدماتی با FASTQ، Alignment و فایل‌های هم‌ترازی پیشنهاد می‌شود.
  • آمادگی کار با لینوکس و دنبال‌کردن مراحل آماده‌سازی داده برای تمرین‌ها مفید است.

سرفصل‌ها ۲ فصل

  • دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS - قسمت ۱
  • دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS - قسمت ۲
  • دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS - قسمت ۳
  • دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS - قسمت ۴

  • دوره آنالیز بالینی CNV در داده‌های NGS - لایو اینستاگرام
  • دیتاهای دوره

آزمون‌ها

  • آزمون نهایی دوره آنالیز CNVها در داده‌های NGS ۱۲ سوال

آزمون‌ها پس از ثبت‌نام در دوره فعال می‌شوند.

نظرات دانشجویان

هنوز نظری ثبت نشده است. اولین نفر باشید!

مدرس
Milad Eidi
Milad Eidi
متخصص بیوانفورماتیک

مدرس باتجربه در حوزه‌ی بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی.

مشخصات دوره
  • ۲ فصل
  • ۶ درس
  • دسترسی مادام‌العمر