NGS و بیوانفورماتیک

Variant Annotation and Filtering—WES Workflow, Part 2

Move from a raw VCF to prioritized candidates through annotation, evidence-based filtering, and practical variant-interpretation workflows.

Milad Eidi 29 lessons
Variant Annotation and Filtering—WES Workflow, Part 2
9,990,000 Toman
Login to Purchase

30-Day Money-Back Guarantee

What You'll Learn

  • Annotate variants and work with databases used by ANNOVAR
  • Filter and prioritize candidates with Excel and command-line tools
  • Apply interpretation frameworks and use Exomiser and LIRICAL in an analysis workflow

About This Course

Once variants have been called, the challenge is finding the candidates that deserve closer investigation. This course shows you how to enrich a VCF with annotations, filter variants systematically, and use evidence and prioritization tools to focus your analysis.

Part 2 of the WES pathway uses practical examples from five patient datasets. Excel and Linux command-line methods are taught alongside automated tools so you can understand how data, filters, and interpretation connect.

Three pillars of the course

  • Variant annotationUse web-based and standalone annotation approaches, explore relevant databases, and prepare resources for ANNOVAR.
  • Filtering and prioritizationPrioritize candidates with Excel and Linux command-line tools, then explore Exomiser and LIRICAL.
  • Evidence and interpretationReview germline and somatic ACMG/AMP concepts and the incidental-findings guidance covered in the course.

Who is this course for?

  • Analysts with a VCF who are ready for the next stage of WES analysis.
  • Students, researchers, and professionals interested in variant prioritization and interpretation.

Course preview

Complete the pathway

Recommended preparation

  • Familiarity with VCF files, variants, and variant calling is recommended.
  • Basic Excel and Linux command-line skills will help you follow the practical methods.

Curriculum 1 sections

  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۲
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۳
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - فوق برنامه
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۴
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۵
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۶
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۷
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۸
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۹
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۰
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۱
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۲
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۳
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۴
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۴ پلاس
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۵
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۵ پلاس
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۶
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۷
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۷ پلاس
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۸
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۱۹
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۲۰
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت ۲۱
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش ۲) - قسمت 22
  • دوره تفسیر و فیلتراسیون واریانت‌ها (بخش2) - قسمت 23
  • آپدیت - آنالیز با نرم افزار LIRICAL
  • دانلود جلسات اسکایپ ماهانه دوره‌های WES

Student Reviews

No reviews yet. Be the first to review this course!

Instructor
Milad Eidi
Milad Eidi
Bioinformatics Expert

Experienced instructor in bioinformatics and computational biology.

Course Details
  • 1 sections
  • 29 lessons
  • Full lifetime access