دوره آنالیز Bulk RNA-Seq

این بخش شامل سرفصل‌های ذیل می‌باشد:

• مقدمات طراحی یک آزمایش RNA-Seq

• Gene level differential expression analysis using HISAT2-FeatureCounts-DESeq2-EdgeR-Limma

• Isoform level (Transcript level) differential expression analysis using HISAT2-StringTie-Ballgown & Kallisto-Sleuth

• Batch Effect Correction

• Plotting

• Multi-Condition differential expression analysis

• Gene ontology enrichment analysis

• Co-expression network construction & functional module detection using WGCNA

• Module Membership & Gene Significance Analysis

• Network Visualization in Cytoscape

• فرآیند فرآخوانی واریانت‌ها از دیتای RNA-Seq

در انتهای این دوره یک دوره رایگان آنالیز Circulating RNA identification and quantification از داده های RNA seq هم اضافه شده است.

سرفصل‌های بخش CircRNAs:

• Introduction
• Identification and quantification of circRNAs using two pipelines
• Differential Expression Analysis of circRNAs