منابع آنالیز NGS
پایگاه داده مناسب را سریع‌تر پیدا کنید
فایل‌های ژنوم مرجع، منابع فراخوانی واریانت و پایگاه‌های انوتیشن را بر اساس کاربرد و نسخه ژنوم در این صفحه پیدا و دانلود کنید.
پیش از دانلود، نسخه ژنوم و نام کروموزوم‌ها را با فایل‌های پروژه خود تطبیق دهید. نسخه هر منبع کنار لینک آن آمده است.
ترازبندی و ژنوم مرجع
بازتنظیم کیفیت؛ BQSR و VQSR
فراخوانی واریانت سوماتیک؛ Mutect2
پایگاه‌های داده ANNOVAR
تفسیر فنوتیپ و ژنوتیپ
منابع بیشتر و پیشنهادهای شما
نسخه hg38 پایگاه gnomAD v4.1 از طریق وب‌سایت ANNOVAR در دسترس است. فایل InterVar و ایندکس متناظر آن را با هم دریافت کنید.
اگر پایگاه داده دیگری برای پروژه خود نیاز دارید، نام و نسخه آن را در دیدگاه‌ها بنویسید.
مشاهده دوره‌های آنالیز NGS
دیدگاه‌ها (۲)
با سلام و عرض ادب و احترام خدمت شما استاد گرامی امکانش هست استاد همانند ژنوم رفرنس hg19 که با BWA MEM الاین کرده اید همین کار را با ژنوم رفرنس hg38 (Broad Institute) انجام دهید. سپاسگزارم استاد
بله حتما در اسرع وقت
برای ثبت دیدگاه لطفاً وارد شوید.
ورود ثبت‌نام